Для осуществления образовательной деятельности Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет располагает необходимыми учебными и вспомогательными помещениями, обеспечивающими качественную подготовку бакалавров, специалистов и магистров. Материально-техническая и учебно-информационная база университета постоянно развиваются.
Университет имеет 29 зданий, общей площадью 147723 кв.м., оборудованных системой видеонаблюдения. СПбГПМУ имеет 10 компьютерных классов, в которых проводятся учебные занятия по различным дисциплинам. На территории вуза работают 6 пунктов питания (общей вместимостью на 196 посадочных мест), в том числе 3 из них находятся в зданиях общежитий.
Библиотека при университете имеет обширную базу научной литературы.
В СПбГПМУ активно работает Центр современных образовательных технологий, в котором обучающиеся активно осваивают практические навыки, используя тренажеры, фантомы и симуляторы.
Научно-исследовательский центр (НИЦ) является структурным подразделением научно-исследовательского отдела университета. В его состав входят 5 лабораторий:
-лаборатория молекулярной диагностики с расширенной группой по экогенетике;
-лаборатория клинической иммунологии;
-лаборатория новых медицинских технологий;
-лаборатория нейрокогнитивных технологий;
-лаборатория экспериментальной медицины.
Детская клиническая больница при Санкт-Петербургском государственном педиатрическом медицинском университете (клиника ГБОУ ВПО СПбГПМУ Минздрава России) — крупнейшая в России. Она является ведущим многопрофильным федеральным медицинским учреждением, основывающимся на огромной научной базе и вековых традициях Ленинградской школы детских врачей. Клиника ГБОУ ВПО СПбГПМУ Минздрава России в своём составе имеет:
-консультативно-диагностический центр (КДЦ);
-Современный перинатальный центр;
-более двадцати профильных стационарных отделений на 815 коек.
Для проведения учебно-тренировочных занятий и соревнований по физической культуре и различным видам спорта университет располагает современным комплексом, куда входят:
-залы для занятий спортивными играми;
-залы для занятий фитнесом и видами единоборств;
-3 зала, оборудованные тренажерными устройствами различной направленности;
-зал для занятий гимнастикой и акробатикой;
-зал для занятий со студентами с ослабленным здоровьем;
-лыжная база;
-летний оздоровительный лагерь «Карелия».
В составе университета имеются 4 студенческих общежития, одна из которых гостиничного типа. В каждом общежитии имеется все необходимое для комфортного проживания, домашнего обучения, досуга и отдыха (например, в каждом общежитии присутствует тренажерный зал). Предоставление места в общежитии при университете гарантируется всем студента, направленным по линии организации «Global Education».
